医学方法

Fisher卡方

Fisher卡方

  • ##### 分析方法视频解读:
  • ##### 案例数据下载
  • ##### 数据格式说明
  • 卡方检验研究数据的独立性,在分析样本量较少(比如小于40),也或者期望频数出现小于5时,此时使用fisher卡方检验较为适合。SPSSzero医学研究模块中的卡方检验时,有提供22即4表格时提供fisher卡方检验p 值,但当为RC结构时,也或者为汇总表格数据时,可使用fisher卡方按钮单独进行计算。

fisher卡方理论依据为超几何分布,其利用排列的数学原理进行计算,在样本量较大计算量非常大,并且fisher卡方基本上均是针对小样本量数据进行计算,因而SPSSzero 在总样本量大于200时依旧不提供fisher卡方检验值。

  • - ###### 特别提示:
    • SPSSzero 系统中共有3处(包括通用方法->交叉卡方,医学研究->卡方检验,医学研究->fisher卡方)提供pearson卡方检验值;
    • SPSSzero 系统中共有2处(医学研究->卡方检验,此处仅提供2*2时fisher卡方检验值,医学研究->fisher卡方)提供fisher卡方检验。

Fisher卡方检验案例

  • #### 1、背景

当前有一项HBV感染医学研究,并被试分为预防组和非预防组,共两组,并且记录阳性和阴性的数据,汇总如下表,似问两组数据HBV感染率有无差别?数据如下:

组别 阳性 阴性 总计
预防组 4 18 22
非预防组 5 6 11
总计 9 24 33
  • #### 2、理论

Fisher卡方检验利用超几何分布原理进行计算,共不同与pearson卡方检验会提供卡方值和p 值两项。Fisher卡方检验时仅提供p 值。SPSSzero 在医学研究模块->卡方检验方法中提供22时卡方检验,如果是汇总表格格式,也或者RC结构时,可使用fisher卡方按钮完成计算。

  • #### 3、操作

本案例操作如下,A1单元格一定要空着,并且放入的数据不包括合计数据,如下图:

  • #### 4、SPSSzero 输出结果

SPSSzero共输出3个表格,如下说明:

说明
检验统计量 展示fisher卡方、pearson卡方和连续校正卡方统计量
期望频数 展示期望频数,辅助判断是否使用fisher卡方的必要性
实际频数 展示实际频数且提示百分比展示切换查看,便于查看数据
  • #### 5、文字分析
检验统计量
检验 卡方值 p
Fisher卡方 - 0.121
Pearson卡方 2.750 0.097
连续校正卡方 1.547 0.214

上表格展示出fisher卡方、pearson卡方和连续校正卡方统计量,从上表可知:fisher卡方时仅提供p 值,而且从pearson卡方和连续校正卡方对应的p 值来看,3个值均呈现出一致性结论即:预防组与非预防组时HPV感染情况无明显差异。

  • ##### 特别提示:
  • 通常情况下:如果总样本量>40且期望频数值全部均大于5时,一般使用pearshon卡方值,如果总样本量大于40,但出现期望频数小于5的单元格时,可优先使用连续校正卡方,也或者使用fisher卡方值,如果总样本量小于40,也或者出现期望频数小于1的单元格时,此时建议使用fisher卡方检验。具体以文献为准即可,可能不同文献的标准不完全一致。
期望频数
阳性 阴性 总计
预防组 6.0 16.0 22
非预防组 3.0 8.0 11
总计 9 24 33

上表格展示各单元格的期望频数,上表格可以看到,非预防组阳性的期望频数为3.0<5,并且总样本量为33,因而本案例数据使用fisher卡方检验量较为适合。

上表格展示实际频数,并且可通过下拉选择切换展示效果,按频数或者按百分比展示。

  • #### 6、剖析

涉及以下几个关键点,分别如下:

  • 如果希望进行卡方多重比较等,需要使用SPSSzero医学研究模块里面的卡方检验功能;
  • 如果总样本量大于200时,此时SPSSzero不提供fisher卡方检验量,但依旧提供perason统计量和连续校统计量。